世界の裏で暗躍する秘密結社“守護法院”に属する少女・アルカ＝ノーチラス。
ある日、彼女は上官から結社内の最高機密に関わる密命を受ける。

“とある少女を日本まで護衛して欲しい”

アルカの前に差し出されたのは、まるで人形の様に佇む沈黙の少女“リト”。
秘密のヴェールにつつまれた少女と邂逅を果たした時、アルカの運命の歯車がゆっくりと狂い始める――。